Zona Portile de Fier a fost declarata parc national datorita variatiei biologice, combinata cu o mare diversitate morfologica si climatica, aceasta variatie biologica a contribuit in mare masura la infrumutesarea peisajului.
Pe teritoriul Portile de Fier se intalneste o bogata, abundenta creata de diferitele specii de plante. Doar in portiunea dintre Insula Simana si Orosva cupride 1253 de specii, la care se adauga 841 de specii din Defileul Dunarii, mai mult de jumatate din numarul total de specii din Romania.
Muntele Domogled, este o veritabila gradina botanica, fiind socotit locul cu cea mai mare flora din Europa.
Vegetatia acestei zone cuprinde 30% elemente euroasiatice iar in rest fiind dominata de elemante mediteraneene, submediteraneene si est-balcanice.
Dintre plantele maditeraneene amintim: drobita, laleaua de Cazane, gladiola de Dalmatia, satanjenelul galben, deditelul mare, visinul turcesc, nucul salbatic, somochinul, iedera, jugastrul spaniol, sofranul, volbura spaniola, dafinul, liliacul etc.
Padurile au un rol deosebit, in zona Portile de Fier, deoarece ele dau imagini estetice de mare valoare acestei zone, la fel ca si liliacul care la inceputul lunii mai acopera toti versatii muntilor Mehdinti, dandu-i un ascpect liliachiu.
In zona turistica Portile de Fier caracteristici sant padurile terofile, iubitoare de caldura ca mojdreanul, artarul trilobat, alunul turcesc, pinul de Banat etc. In vaile si depresiunile adapostite creste fagul balcanic, iar pe versantii cu expunere sudica creste stejarul pufos, care aminteste de padurile din sudul Europei. Interesant de semnalat aici este faputl ca teiul sta in floare 25 de zile. Pe versantii umbriti ai muntilor se afla paduri de fag in amestec cu carpen si fag de Caucaz.
Padurile din imprejurimile Bailor Herculane, influenteaza conditiile climatice, prin atenuarea vitezei vanturilor, filtrarea aerului de impuritati, reducerea intensitatii luminii solare si atenuarea extremelor de temperatura.